Rubīdijs (85,47 u) organismā ir nelielā daudzumā. Kopumā cilvēka organismā ir ap 1 g rubīdija. Rubīdija pārtikas avoti ir tēja, kafija un minerālūdeņi. Minimālā ikdienas nepieciešamība pēc rubīdija cilvēkam ir 0,1 mg. Pastiprināta rubīdija nokļūšana organismā var būt elektroniskās, ķīmiskās un stikla rūpniecības darbiniekiem. Pēc kinētikas, nokļūšanas veida organismā, izdalīšanās un izvadīšanas veida no organisma rubīdijs ir līdzīgs kālijam. Tas ātri uzsūcas no kuņģa-zarnu trakta, asinīs atrodas pārsvarā eritrocītos un tiek izvadīts galvenokārt caur nierēm.
Potenciāli tas var izpausties kā kālija konkurents. Eksperimenti uzrāda kālijam līdzīgu fizioloģisko iedarbību uz muskuļu saraušanos un skābju-bāzes līdzsvaru. Palielinātu rubīdija koncentrāciju toksiskuma mehānismi eksperimentos parāda arī sakritību ar kālija pārdaudzuma toksiskumu.
Rubīdija fizioloģiskā nozīme ir tā spējā inhibēt prostaglandīnus PGE1 un PGE2, PGE2-аlfa un tā antihistamīnu īpašību izpausmes. Apdraudējumu veselībai rada radioaktīvais izotops 87Rb. Parasti tam tiek izmantoti līdz 28% no vispārējā organismā nokļuvušā rubīdija satura. Rubīdija pārdaudzums var radīt lokālus ādas un gļotādu bojājumus, hronisku augšējo elpceļu iekaisumu, aritmiju, miega traucējumus, galvassāpes un proteīnūriju. Rubīdija saturs mazāk par 250 μg/kg eksperimentālo dzīvnieku barībā var izraisīt intrauterīna attīstības aizkavēšanos, abortus un priekšlaicīgas dzemdības.
Eksperimentālās medicīnas un bioloģijas pēdējās desmitgadēs tiek pētītas rubīdija sāļu izmantošanas iespējas nervu un muskuļu sistēmu ārstēšanā. Medicīnā radioaktīvos rubīdija izotopus izmanto radioloģiskajās izpētes metodēs.